1- Verificar que o DNS está ok
Verificar os ponteiros DNS (apontar para o servidor local).
nslookup -type=ns nomeatual.net
2- Elevar o nível funcional do domínio para Server 2003
3- Instalar suptools.msi (CD-ROM W2K3\SUPPORT\TOOLS)
4- Renoemando o Controlador de domínio
netdom computername NomeAtual /add:NovoNome
Ex. netdom computername Servidor2 /add:servidor3.walter.net
Este comando atualizará os atributos do nome principal de serviço (SPN) no Active Directory para essa conta de computador e registrará os registros de recursos DNS para o novo nome de computador.
5- Verifique se as atualizações e os registros DNS da conta do computador estão completos usando o comando abaixo.
netdom computername NomeAtual /makeprimary:NovoNome
6- Reinicie o computador
7- Removendo o nome antigo
netdom computername NovoNome /remove:NomeAntigo
8- Testar A.D., Politicas, DNS e outros recursos que se façam necessários
Fonte: